Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPANXA1Q9NS26 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPANXA1Q9NS26 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXA1Q9NS26 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXA1Q9NS26 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms