Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM167BQ9NRX6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMEM167BQ9NRX6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM167BQ9NRX6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM167BQ9NRX6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMEM167BQ9NRX6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM167BQ9NRX6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM167BQ9NRX6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM167BQ9NRX6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM167BQ9NRX6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms