Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALMDQ9NP74 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms