Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RPF2Q9H7B2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPF2Q9H7B2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPF2Q9H7B2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPF2Q9H7B2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPF2Q9H7B2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPF2Q9H7B2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPF2Q9H7B2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPF2Q9H7B2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPF2Q9H7B2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPF2Q9H7B2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPF2Q9H7B2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPF2Q9H7B2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPF2Q9H7B2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms