Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCXQ9H320 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCXQ9H320 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCXQ9H320 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCXQ9H320 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCXQ9H320 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VCXQ9H320 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCXQ9H320 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCXQ9H320 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCXQ9H320 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCXQ9H320 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCXQ9H320 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCXQ9H320 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCXQ9H320 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCXQ9H320 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms