Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2V7

SPNS1, Protein spinster homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1Q9H2V7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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