Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
EHD4Q9H223 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EHD4Q9H223 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EHD4Q9H223 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
EHD4Q9H223 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EHD4Q9H223 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EHD4Q9H223 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
EHD4Q9H223 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EHD4Q9H223 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EHD4Q9H223 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
EHD4Q9H223 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
EHD4Q9H223 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EHD4Q9H223 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EHD4Q9H223 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EHD4Q9H223 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EHD4Q9H223 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EHD4Q9H223 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
EHD4Q9H223 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
EHD4Q9H223 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EHD4Q9H223 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EHD4Q9H223 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EHD4Q9H223 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms