Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM15Q9C019 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM15Q9C019 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM15Q9C019 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM15Q9C019 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM15Q9C019 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM15Q9C019 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM15Q9C019 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM15Q9C019 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM15Q9C019 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM15Q9C019 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM15Q9C019 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM15Q9C019 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM15Q9C019 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM15Q9C019 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM15Q9C019 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms