Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CELF4Q9BZC1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CELF4Q9BZC1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CELF4Q9BZC1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CELF4Q9BZC1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CELF4Q9BZC1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CELF4Q9BZC1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CELF4Q9BZC1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CELF4Q9BZC1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CELF4Q9BZC1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CELF4Q9BZC1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CELF4Q9BZC1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CELF4Q9BZC1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CELF4Q9BZC1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CELF4Q9BZC1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CELF4Q9BZC1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CELF4Q9BZC1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CELF4Q9BZC1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CELF4Q9BZC1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CELF4Q9BZC1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms