Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD2AQ9BW72 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD2AQ9BW72 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms