Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD7Q9BUK0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD7Q9BUK0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHCHD7Q9BUK0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD7Q9BUK0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD7Q9BUK0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD7Q9BUK0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD7Q9BUK0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHCHD7Q9BUK0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD7Q9BUK0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD7Q9BUK0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD7Q9BUK0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 566.9 ms