Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS4Q9BT78 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS4Q9BT78 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS4Q9BT78 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS4Q9BT78 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPS4Q9BT78 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS4Q9BT78 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS4Q9BT78 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS4Q9BT78 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS4Q9BT78 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS4Q9BT78 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS4Q9BT78 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS4Q9BT78 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS4Q9BT78 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS4Q9BT78 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS4Q9BT78 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS4Q9BT78 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms