Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EIF3CQ99613 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EIF3CQ99613 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF3CQ99613 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF3CQ99613 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF3CQ99613 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EIF3CQ99613 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EIF3CQ99613 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF3CQ99613 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF3CQ99613 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF3CQ99613 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EIF3CQ99613 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EIF3CQ99613 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF3CQ99613 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3CQ99613 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3CQ99613 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms