Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF3RQ99062 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF3RQ99062 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSF3RQ99062 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF3RQ99062 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF3RQ99062 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms