Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TEFMQ96QE5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TEFMQ96QE5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TEFMQ96QE5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TEFMQ96QE5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TEFMQ96QE5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TEFMQ96QE5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TEFMQ96QE5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TEFMQ96QE5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TEFMQ96QE5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TEFMQ96QE5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TEFMQ96QE5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TEFMQ96QE5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TEFMQ96QE5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TEFMQ96QE5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TEFMQ96QE5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TEFMQ96QE5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TEFMQ96QE5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TEFMQ96QE5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TEFMQ96QE5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TEFMQ96QE5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms