Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIB3Q96Q77 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIB3Q96Q77 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIB3Q96Q77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIB3Q96Q77 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIB3Q96Q77 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIB3Q96Q77 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIB3Q96Q77 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIB3Q96Q77 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIB3Q96Q77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIB3Q96Q77 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIB3Q96Q77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIB3Q96Q77 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CIB3Q96Q77 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIB3Q96Q77 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CIB3Q96Q77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIB3Q96Q77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIB3Q96Q77 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIB3Q96Q77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIB3Q96Q77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIB3Q96Q77 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CIB3Q96Q77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIB3Q96Q77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIB3Q96Q77 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIB3Q96Q77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.2 ms