Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH12Q96NR8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RDH12Q96NR8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH12Q96NR8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RDH12Q96NR8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RDH12Q96NR8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH12Q96NR8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH12Q96NR8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms