Protein–RNA interactions for Protein: Q96K19

RNF170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170Q96K19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF170Q96K19 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF170Q96K19 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF170Q96K19 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF170Q96K19 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF170Q96K19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF170Q96K19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF170Q96K19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.5 ms