Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSL1Q96IY1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSL1Q96IY1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSL1Q96IY1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSL1Q96IY1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSL1Q96IY1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSL1Q96IY1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSL1Q96IY1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSL1Q96IY1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSL1Q96IY1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSL1Q96IY1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSL1Q96IY1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSL1Q96IY1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSL1Q96IY1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSL1Q96IY1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSL1Q96IY1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSL1Q96IY1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSL1Q96IY1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms