Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC46Q96FV0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC46Q96FV0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC46Q96FV0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC46Q96FV0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC46Q96FV0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms