Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NMD3Q96D46 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NMD3Q96D46 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NMD3Q96D46 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NMD3Q96D46 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NMD3Q96D46 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NMD3Q96D46 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NMD3Q96D46 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NMD3Q96D46 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms