Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TSR2Q969E8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TSR2Q969E8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TSR2Q969E8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TSR2Q969E8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TSR2Q969E8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TSR2Q969E8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TSR2Q969E8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TSR2Q969E8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TSR2Q969E8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TSR2Q969E8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
TSR2Q969E8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TSR2Q969E8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TSR2Q969E8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TSR2Q969E8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TSR2Q969E8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TSR2Q969E8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TSR2Q969E8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TSR2Q969E8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TSR2Q969E8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TSR2Q969E8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TSR2Q969E8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TSR2Q969E8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TSR2Q969E8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TSR2Q969E8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
TSR2Q969E8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TSR2Q969E8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TSR2Q969E8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TSR2Q969E8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TSR2Q969E8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TSR2Q969E8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TSR2Q969E8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TSR2Q969E8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TSR2Q969E8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms