Protein–RNA interactions for Protein: Q92985

IRF7, Interferon regulatory factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF7Q92985 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF7Q92985 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF7Q92985 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF7Q92985 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IRF7Q92985 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRF7Q92985 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF7Q92985 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF7Q92985 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF7Q92985 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF7Q92985 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF7Q92985 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF7Q92985 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF7Q92985 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF7Q92985 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRF7Q92985 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRF7Q92985 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IRF7Q92985 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRF7Q92985 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRF7Q92985 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRF7Q92985 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IRF7Q92985 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IRF7Q92985 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRF7Q92985 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRF7Q92985 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRF7Q92985 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRF7Q92985 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRF7Q92985 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRF7Q92985 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRF7Q92985 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRF7Q92985 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRF7Q92985 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRF7Q92985 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRF7Q92985 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF7Q92985 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF7Q92985 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF7Q92985 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF7Q92985 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF7Q92985 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF7Q92985 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF7Q92985 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms