Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A6Q92581 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A6Q92581 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC9A6Q92581 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A6Q92581 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A6Q92581 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A6Q92581 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms