Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM9SF4Q92544 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TM9SF4Q92544 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM9SF4Q92544 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM9SF4Q92544 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM9SF4Q92544 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms