Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW59

SPRYD4, SPRY domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD4Q8WW59 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPRYD4Q8WW59 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRYD4Q8WW59 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRYD4Q8WW59 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRYD4Q8WW59 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRYD4Q8WW59 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRYD4Q8WW59 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRYD4Q8WW59 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD4Q8WW59 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD4Q8WW59 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPRYD4Q8WW59 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD4Q8WW59 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRYD4Q8WW59 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms