Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM171Q8WVE6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM171Q8WVE6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM171Q8WVE6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM171Q8WVE6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM171Q8WVE6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM171Q8WVE6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM171Q8WVE6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM171Q8WVE6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM171Q8WVE6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM171Q8WVE6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM171Q8WVE6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM171Q8WVE6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM171Q8WVE6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM171Q8WVE6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms