Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C15orf40Q8WUR7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C15orf40Q8WUR7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C15orf40Q8WUR7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C15orf40Q8WUR7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C15orf40Q8WUR7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf40Q8WUR7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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