Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSKUQ8WUA8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSKUQ8WUA8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSKUQ8WUA8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSKUQ8WUA8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TSKUQ8WUA8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms