Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LMO3Q8TAP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO3Q8TAP4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMO3Q8TAP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMO3Q8TAP4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO3Q8TAP4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LMO3Q8TAP4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms