Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MSANTD4Q8NCY6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSANTD4Q8NCY6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MSANTD4Q8NCY6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSANTD4Q8NCY6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MSANTD4Q8NCY6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSANTD4Q8NCY6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms