Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF4

Putative uncharacterized protein FLJ33307, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8NBF4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8NBF4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8NBF4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8NBF4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8NBF4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8NBF4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8NBF4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8NBF4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8NBF4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8NBF4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8NBF4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8NBF4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8NBF4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8NBF4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8NBF4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8NBF4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8NBF4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8NBF4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8NBF4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8NBF4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8NBF4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8NBF4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8NBF4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8NBF4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8NBF4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8NBF4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8NBF4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8NBF4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8NBF4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8NBF4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8NBF4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8NBF4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8NBF4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8NBF4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8NBF4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8NBF4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8NBF4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8NBF4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8NBF4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8NBF4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8NBF4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8NBF4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8NBF4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8NBF4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8NBF4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8NBF4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8NBF4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8NBF4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8NBF4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8NBF4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8NBF4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8NBF4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8NBF4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8NBF4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8NBF4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8NBF4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8NBF4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8NBF4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8NBF4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8NBF4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8NBF4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8NBF4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8NBF4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8NBF4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8NBF4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8NBF4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8NBF4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8NBF4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8NBF4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8NBF4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8NBF4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8NBF4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8NBF4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8NBF4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8NBF4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8NBF4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8NBF4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8NBF4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8NBF4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8NBF4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8NBF4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8NBF4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8NBF4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8NBF4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8NBF4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8NBF4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8NBF4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8NBF4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8NBF4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8NBF4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8NBF4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8NBF4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8NBF4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8NBF4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8NBF4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8NBF4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8NBF4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8NBF4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8NBF4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8NBF4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms