Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNPLA1Q8N8W4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNPLA1Q8N8W4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNPLA1Q8N8W4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNPLA1Q8N8W4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNPLA1Q8N8W4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNPLA1Q8N8W4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNPLA1Q8N8W4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNPLA1Q8N8W4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PNPLA1Q8N8W4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PNPLA1Q8N8W4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNPLA1Q8N8W4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNPLA1Q8N8W4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNPLA1Q8N8W4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNPLA1Q8N8W4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNPLA1Q8N8W4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNPLA1Q8N8W4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNPLA1Q8N8W4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PNPLA1Q8N8W4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PNPLA1Q8N8W4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms