Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf62Q8N4C0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf62Q8N4C0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf62Q8N4C0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf62Q8N4C0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf62Q8N4C0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf62Q8N4C0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms