Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC105Q8IYK2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC105Q8IYK2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC105Q8IYK2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC105Q8IYK2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC105Q8IYK2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC105Q8IYK2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC105Q8IYK2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC105Q8IYK2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC105Q8IYK2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC105Q8IYK2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC105Q8IYK2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC105Q8IYK2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC105Q8IYK2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC105Q8IYK2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC105Q8IYK2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC105Q8IYK2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC105Q8IYK2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC105Q8IYK2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC105Q8IYK2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC105Q8IYK2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC105Q8IYK2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC105Q8IYK2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC105Q8IYK2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC105Q8IYK2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC105Q8IYK2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC105Q8IYK2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC105Q8IYK2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC105Q8IYK2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC105Q8IYK2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC105Q8IYK2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC105Q8IYK2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC105Q8IYK2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC105Q8IYK2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC105Q8IYK2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms