Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ8

SUGP1, SURP and G-patch domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGP1Q8IWZ8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SUGP1Q8IWZ8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUGP1Q8IWZ8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUGP1Q8IWZ8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUGP1Q8IWZ8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUGP1Q8IWZ8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUGP1Q8IWZ8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUGP1Q8IWZ8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUGP1Q8IWZ8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUGP1Q8IWZ8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUGP1Q8IWZ8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUGP1Q8IWZ8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUGP1Q8IWZ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUGP1Q8IWZ8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUGP1Q8IWZ8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUGP1Q8IWZ8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUGP1Q8IWZ8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUGP1Q8IWZ8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUGP1Q8IWZ8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUGP1Q8IWZ8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUGP1Q8IWZ8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUGP1Q8IWZ8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUGP1Q8IWZ8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUGP1Q8IWZ8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUGP1Q8IWZ8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUGP1Q8IWZ8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUGP1Q8IWZ8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms