Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV50

LYSMD2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD2Q8IV50 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYSMD2Q8IV50 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYSMD2Q8IV50 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYSMD2Q8IV50 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYSMD2Q8IV50 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD2Q8IV50 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYSMD2Q8IV50 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms