Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDLRAD3Q86YD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD3Q86YD5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD3Q86YD5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD3Q86YD5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD3Q86YD5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD3Q86YD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD3Q86YD5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD3Q86YD5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD3Q86YD5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD3Q86YD5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD3Q86YD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD3Q86YD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD3Q86YD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LDLRAD3Q86YD5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms