Protein–RNA interactions for Protein: Q86US8

SMG6, Telomerase-binding protein EST1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6Q86US8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMG6Q86US8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMG6Q86US8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMG6Q86US8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMG6Q86US8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMG6Q86US8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SMG6Q86US8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMG6Q86US8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMG6Q86US8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMG6Q86US8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMG6Q86US8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
SMG6Q86US8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMG6Q86US8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMG6Q86US8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMG6Q86US8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SMG6Q86US8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMG6Q86US8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMG6Q86US8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMG6Q86US8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMG6Q86US8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMG6Q86US8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMG6Q86US8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMG6Q86US8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMG6Q86US8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMG6Q86US8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMG6Q86US8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMG6Q86US8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMG6Q86US8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMG6Q86US8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMG6Q86US8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMG6Q86US8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMG6Q86US8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SMG6Q86US8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMG6Q86US8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMG6Q86US8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMG6Q86US8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMG6Q86US8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMG6Q86US8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMG6Q86US8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
SMG6Q86US8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMG6Q86US8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMG6Q86US8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMG6Q86US8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMG6Q86US8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMG6Q86US8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMG6Q86US8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMG6Q86US8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMG6Q86US8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SMG6Q86US8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SMG6Q86US8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms