Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDF3Q7Z739 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDF3Q7Z739 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDF3Q7Z739 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDF3Q7Z739 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDF3Q7Z739 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDF3Q7Z739 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDF3Q7Z739 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
YTHDF3Q7Z739 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
YTHDF3Q7Z739 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YTHDF3Q7Z739 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YTHDF3Q7Z739 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YTHDF3Q7Z739 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YTHDF3Q7Z739 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YTHDF3Q7Z739 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDF3Q7Z739 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YTHDF3Q7Z739 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDF3Q7Z739 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDF3Q7Z739 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDF3Q7Z739 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDF3Q7Z739 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YTHDF3Q7Z739 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
YTHDF3Q7Z739 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
YTHDF3Q7Z739 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
YTHDF3Q7Z739 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
YTHDF3Q7Z739 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
YTHDF3Q7Z739 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YTHDF3Q7Z739 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
YTHDF3Q7Z739 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
YTHDF3Q7Z739 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
YTHDF3Q7Z739 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
YTHDF3Q7Z739 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms