Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CACNA2D4Q7Z3S7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms