Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFPL4BQ6ZWI9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFPL4BQ6ZWI9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFPL4BQ6ZWI9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFPL4BQ6ZWI9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4BQ6ZWI9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFPL4BQ6ZWI9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFPL4BQ6ZWI9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFPL4BQ6ZWI9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFPL4BQ6ZWI9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFPL4BQ6ZWI9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFPL4BQ6ZWI9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL4BQ6ZWI9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms