Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM136Q6ZRR5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM136Q6ZRR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM136Q6ZRR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM136Q6ZRR5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM136Q6ZRR5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM136Q6ZRR5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM136Q6ZRR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM136Q6ZRR5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM136Q6ZRR5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM136Q6ZRR5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM136Q6ZRR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM136Q6ZRR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM136Q6ZRR5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM136Q6ZRR5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM136Q6ZRR5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms