Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LIAT1Q6ZQX7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIAT1Q6ZQX7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LIAT1Q6ZQX7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIAT1Q6ZQX7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms