Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00575Q6W349 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00575Q6W349 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00575Q6W349 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms