Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1N0

CC2D1A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1AQ6P1N0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1AQ6P1N0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CC2D1AQ6P1N0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CC2D1AQ6P1N0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CC2D1AQ6P1N0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CC2D1AQ6P1N0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CC2D1AQ6P1N0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CC2D1AQ6P1N0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CC2D1AQ6P1N0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CC2D1AQ6P1N0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CC2D1AQ6P1N0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CC2D1AQ6P1N0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CC2D1AQ6P1N0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CC2D1AQ6P1N0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CC2D1AQ6P1N0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CC2D1AQ6P1N0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CC2D1AQ6P1N0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CC2D1AQ6P1N0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CC2D1AQ6P1N0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CC2D1AQ6P1N0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms