Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATL3Q6DD88 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ATL3Q6DD88 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATL3Q6DD88 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATL3Q6DD88 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATL3Q6DD88 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATL3Q6DD88 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATL3Q6DD88 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATL3Q6DD88 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATL3Q6DD88 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ATL3Q6DD88 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATL3Q6DD88 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ATL3Q6DD88 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATL3Q6DD88 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATL3Q6DD88 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATL3Q6DD88 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATL3Q6DD88 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATL3Q6DD88 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATL3Q6DD88 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATL3Q6DD88 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATL3Q6DD88 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATL3Q6DD88 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATL3Q6DD88 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATL3Q6DD88 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATL3Q6DD88 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATL3Q6DD88 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATL3Q6DD88 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATL3Q6DD88 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATL3Q6DD88 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATL3Q6DD88 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATL3Q6DD88 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATL3Q6DD88 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATL3Q6DD88 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATL3Q6DD88 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATL3Q6DD88 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATL3Q6DD88 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATL3Q6DD88 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATL3Q6DD88 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATL3Q6DD88 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms