Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD13Q5VXD3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SAMD13Q5VXD3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SAMD13Q5VXD3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAMD13Q5VXD3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms