Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD3CQ5T2N8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3CQ5T2N8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3CQ5T2N8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3CQ5T2N8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3CQ5T2N8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3CQ5T2N8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAD3CQ5T2N8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAD3CQ5T2N8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3CQ5T2N8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD3CQ5T2N8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD3CQ5T2N8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD3CQ5T2N8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3CQ5T2N8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD3CQ5T2N8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms