Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1Q4

SLC35F1, Solute carrier family 35 member F1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F1Q5T1Q4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35F1Q5T1Q4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35F1Q5T1Q4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35F1Q5T1Q4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35F1Q5T1Q4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35F1Q5T1Q4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35F1Q5T1Q4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35F1Q5T1Q4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC35F1Q5T1Q4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC35F1Q5T1Q4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35F1Q5T1Q4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35F1Q5T1Q4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC35F1Q5T1Q4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC35F1Q5T1Q4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC35F1Q5T1Q4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms